上海市中医文献馆门诊部成立于60年代中期，成立的目的旨在继承发扬名老中医学术经验，并使之服务于人民大众。
1988年随着人民生活水平日益提高，上海市中医文献馆门诊部在全市率先开设了专家门诊，以发挥上海中医界老中医、老专家的医疗优势，其中有多位名老中医在我门诊部施诊，如董廷瑶、姜春华、陈苏生、裘沛然、颜德馨 、钱伯文等，每年治愈各种疑难病症患者数万余人，深受患者好评 。
2001年上海市中医文献馆门诊部被纳入上海市医保定点医疗机构，随着事业的不断发展，同时也为了又满足了不同层次的需求，门诊部于2002年又增设了特需门诊，就诊环境更为优雅，设施更为齐备。目前门诊科室齐全，专家汇集，欢迎各地患者前来求诊。